В силу п. 1 ст. 346.15 НК РФ доходами при применении упрощенной системы налогообложения признаются доходы от реализации и внереализационные доходы, которые определяются согласно ст. ст. 249 и 250 НК РФ соответственно.

Согласно Письму от 31.08.2006 N 18-11/3/76605@ УФНС России по г. Москве ошибочно перечисленные денежные средства не являются доходом от реализации или внереализационным доходом, поэтому  указанные суммы не учитываются в качестве доходов.

Таким образом, ошибочно поступившие на расчетный счет денежные средства, которые впоследствии возвращены контрагенту, не учитываются в составе доходов при применении УСН

Минфин России в Письме от 24.06.2011 N 03-11-06/2/97 указал, что условием уплаты страховых взносов по пониженным тарифам является применение УСН в отношении основного вида деятельности. Соответственно, если такая деятельность переведена на ЕНВД, правом на льготные тарифы воспользоваться невозможно.

 Согласно Письму Минфина России от 02.04.2009 N 03-07-09/18) суммы НДС, предъявленные поставщиками принятых на учет товаров, подлежат вычету в том налоговом периоде, в котором от поставщиков получен счет-фактура.

В соответствии с Письмом УФНС России по г. Москве от 03.08.2009 N 16-15/79275 для обоснования вычета при получении счета-фактуры (акта выполненных работ, оказанных услуг) необходим документ, подтверждающий дату получения данных документов, например журнал учета входящей корреспонденции, в случае, если они были направлены поставщиком товаров (работ, услуг) по почте. Подтверждением даты получения счета-фактуры (акта выполненных работ, оказанных услуг), направленного поставщиком товаров (работ, услуг) по почте, является конверт с проставленным на нем штемпелем почтового отделения, через которое получен счет-фактура (акт выполненных работ, оказанных услуг).

Таким образом, при наличии подтверждающих документов о получении счетов-фактур, датированных 2011 годом, организация вправе регистрировать вышеуказанные документы в 2012 году.

Согласно п. 1 ст. 172 гл. 21 "Налог на добавленную стоимость" НК РФ вычеты налога на добавленную стоимость производятся налогоплательщиками на основании счетов-фактур, полученных от продавцов товаров (работ, услуг), либо документов, подтверждающих факт уплаты сумм налога на добавленную стоимость при ввозе товаров на таможенную территорию Российской Федерации, после принятия на учет указанных товаров (работ, услуг) при соблюдении условий, предусмотренных п. 2 ст. 171 Кодекса и п. 1 ст. 172 Кодекса.

В связи с изложенным по лизинговым платежам на основании счетов-фактур, получаемых от лизингодателя, суммы налога на добавленную стоимость принимаются к вычету независимо от момента оплаты лизинговых платежей.

Согласно п.п. 1 п. 2 ст. 170 НК РФ суммы НДС, предъявленные покупателю при приобретении товаров, учитываются в стоимости таких товаров в случае приобретения товаров, используемых для операций по производству или реализации товаров (работ, услуг), не подлежащих налогообложению (освобожденных от налогообложения).

Таким образом, по материалам, находящимся на складе, сумма НДС учитывается в стоимости материалов и на конец квартала не может быть списан в уменьшение налогооблагаемой прибыли

Работники организаций, применяющих специальные налоговые режимы, подлежат обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности на основании нормы п. 1 ч. 1 ст. 2 Федерального закона от 29.12.2006 N 255-ФЗ "Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством". Лица, подлежащие обязательному социальному страхованию на случай временной нетрудоспособности в соответствии с настоящим Федеральным законом, являются застрахованными лицами. Согласно п. 4 ст. 2 Федерального закона от 29.12.2006 N 255-ФЗ застрахованные лица имеют право на получение страхового обеспечения при соблюдении условий, предусмотренных настоящим Федеральным законом. Таким образом, выплаты по больничным листам должны производиться за счёт ФСС.

Организации, применяющие кассовый метод, датой получения дохода признают: - день поступления средств на счета в банках, в кассу организации; - день поступления иного имущества (работ, услуг) и (или) имущественных прав; - день погашения задолженности перед налогоплательщиком иным способом (п. 2 ст. 273 НК РФ). Налоговый кодекс РФ (ст. 271) устанавливает, что налогоплательщики, применяющие метод начисления, признают доходы в том отчетном периоде, в котором они имели место, независимо от фактического поступления денежных средств. Одни и те же доходы не следует учитывать дважды в соответствии с последним абзацем п. 3 ст. 248 НК РФ. Поэтому если организация уже учла какие-то поступления в составе доходов, то повторно она учитывать их не должна.

Таким образом, проценты, начисленные в III квартале 2010 года, должны быть учтены в налогооблагаемой базе 2010 года, а не во II квартале 2011 года. У налогоплательщиков, определяющих доходы и расходы методом начисления, в соответствии с п. 8 ст. 272, абз. 2 п. 4 ст. 328 НК РФ внереализационные расходы в виде процентов по займам (в пределах, определенных в соответствии со ст. 269 НК РФ) отражаются в налоговом учете на конец месяца вне зависимости от даты выплаты денежных средств заимодавцу. Таким образом, проценты начисленные учитываются в налогооблагаемой базе 2010 года.

Правила формирования первоначальной стоимости для целей бухгалтерского учета закреплены в п. 8 ПБУ 6/01 "Учет основных средств". Фактическими затратами на приобретение, сооружение и изготовление основных средств являются: суммы, уплачиваемые в соответствии с договором поставщику (продавцу), а также суммы, уплачиваемые за доставку объекта и приведение его в состояние, пригодное для использования;  суммы, уплачиваемые организациям за осуществление работ по договору строительного подряда и иным договорам; суммы, уплачиваемые организациям за информационные и консультационные услуги, связанные с приобретением основных средств; таможенные пошлины и таможенные сборы; невозмещаемые налоги, государственная пошлина, уплачиваемые в связи с приобретением объекта основных средств; вознаграждения, уплачиваемые посреднической организации, через которую приобретен объект основных средств;  иные затраты, непосредственно связанные с приобретением, сооружением и изготовлением объекта основных средств.

Таким образом, расходы на установку гарантии на сервер следует рассматривать как дополнительные услуги при эксплуатации основного средства и учитывать на счёте 97 “Расходы будущих периодов”.

"Упрощенцы" признают в расходах свои затраты после их фактической оплаты (п. 2 ст. 346.17 НК РФ). Оплатой товаров (работ, услуг) и (или) имущественных прав признается прекращение обязательства их приобретателя перед продавцом, которое непосредственно связано с поставкой этих товаров (выполнением работ, оказанием услуг) и (или) передачей имущественных прав.

Таким образом, расходы признаются в 2011 году по мере оплаты, то есть в январе, августе и ноябре на суммы погашения задолженности.

Место реализации работ (услуг) по договорам, заключенным между хозяйствующими субъектами РФ и Республики Казахстан, определяется нормами Протокола от 11.12.2009 "О порядке взимания косвенных налогов при выполнении работ, оказании услуг в Таможенном союзе». В силу п. 4 ст. 3 Протокола местом реализации при передаче авторских прав является место нахождения организации, приобретающей данные права. В рассматриваемой ситуации приобретателем авторского права на программное обеспечение на АСР является резидент Республики Казахстан, поэтому местом реализации данного права территория РФ не является.

Таким образом, у российской организации, передающей авторские права на использование программного обеспечения казахскому контрагенту, в том числе и по лицензионному договору с сохранением за лицензиаром права выдачи лицензий другим лицам (неисключительная лицензия), объекта налогообложения по НДС не возникает.